La Dra. Maggie Doyle estuvo varias temporadas ejerciendo como doctora, sin ocultar su tendencia sexual.

Aunque a lo largo de las temporadas se hace ciertas insinuaciones de que Weaver pudiera ser lesbiana, no es hasta mediados de la séptima temporada en la que se enamora de la psiquiatra Kim Legaspi, pero Weaver tiene miedo de admitirlo tanto a Legaspi como así misma. Legaspi abiertamente lesbiana y dispuesta a tener una relación con Weaver, comprende que Weaver está aun en el armario y su relación va mucho más despacio de lo que pensaba. Aunque Weaver fue capaz de admitir ante sí misma que es lesbiana, aun se sentía incómoda ante sus compañeros de trabajo, así como delante de parejas de mujeres que viven abiertamente su orientación, como en el episodio 14º de la 7ª temporada donde aparece Christy Larkin con su pareja.

Durante la temporada, Legaspi sufre acusaciones falsas de acoso sexual de una paciente mujer, y aunque consigue mantener su puesto de trabajo, al ver la homofobia de la administración del hospital y a su propia novia que se quedó en el armario, Legaspi rompe con Weaver ante su falta de apoyo emocional, marchándose del hospital.

Kerry sigue con la preocupación de que sus compañeros de trabajo se enteren de que es lesbiana, aunque su orientación sexual ya es conocida por algunos de ellos.

En un tormentoso día de lluvia, mientras intenta socorrer a una mujer embarazada de una ambulancia que sufrió un accidente, Weaver conoce a la bombero Sandy Lopez. Mientras las dos mujeres se van conociendo, Lopez confiesa a Kerry que se niega a salir con una mujer que aun esté en el armario. Lopez impulsivamente da un fuerte beso en los labios a Weaver delante de todos los compañeros de trabajo y tras el beso Lopez dice "Te hice un favor". Al final de la temporada Weaver se acepta a sí misma como lesbiana.

Durante la novena temporada, la relación de Weaver y Lopez se intensifica y Weaver decide tener un hijo juntas, pero tras sufrir un aborto involuntario piensa que es Lopez la que debería intentarlo, sin embargo ella no piensa igual ya que ve peligrar su carrera como bombero.

En la décima temporada Lopez cambia de opinión en cuanto al bebé, dando finalmente a luz a Henry, formando junto a Weaver una pequeña familia. Sin embargo más a delante Lopez muere de las heridas provocadas en un incendio. Devastada por la pérdida, Weaver deberá luchar por la custodia de Henry, ante los padres de Sandy que nunca habían aprobado su orientación sexual y quieren llevarse a su nieto. Finalmente ambas partes llegan a un acuerdo en la custodia.

En la decimotercera temporada, trabajando de nuevo en la sala de urgencias, Weaver llama la atención de una productora de TV que está grabando  junto al doctor Morris, y literalmente le roba el programa. A Weaver le ofrecen un programa y poco después empieza una estrecha relación con su productora Courtney. Tras los recortes hospitalarios, Kerry finalmente acepta el programa de televisión y abandona el County General.